More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2074 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2074  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3266  lysine exporter protein LysE/YggA  93.3 
 
 		 194 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.64518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3069  lysine exporter protein LysE/YggA  80.83 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2429  lysine exporter protein LysE/YggA  93.81 
 
 		 194 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.716497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  48.72 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2389  lysine exporter protein LysE/YggA  57.22 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.64 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2238  hypothetical protein  49.44 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  42.27 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26340  hypothetical protein  50.56 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.56622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  36.07 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  35.87 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  37.22 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  36.07 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  36.17 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  33.72 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.24 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.87 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  36.07 
 
 		 640 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  32.39 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  37.16 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  29.67 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.95 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.36 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  40.96 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  34.66 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  36.7 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  38.59 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  36.41 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 209 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  39.01 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  35.43 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 207 aa  97.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  37.78 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  39.66 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  41.34 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  36.32 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  34.46 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  33.7 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  32.78 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  32.6 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  35.14 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  33.9 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  31.52 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.79 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  28.42 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  31.49 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  41.34 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.21 
 
 		 208 aa  85.1  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  32.95 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  35.88 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  33.87 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  33.33 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  35.8 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  31.32 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>