194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2012 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 
450 aa  925    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.67 
 
 
447 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  58.29 
 
 
461 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  55.48 
 
 
468 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  56.55 
 
 
469 aa  481  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  51.2 
 
 
462 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  52.25 
 
 
459 aa  471  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.94 
 
 
451 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  49.49 
 
 
495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  53.17 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  52.38 
 
 
487 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50.8 
 
 
473 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  53.74 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  47.87 
 
 
506 aa  382  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.31 
 
 
449 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  45.52 
 
 
477 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  45.52 
 
 
477 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  41.51 
 
 
511 aa  348  8e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.27 
 
 
455 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.51 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.94 
 
 
448 aa  320  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.66 
 
 
446 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  37.5 
 
 
453 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  41.19 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.37 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  38.62 
 
 
468 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.46 
 
 
462 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.77 
 
 
467 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  39.6 
 
 
467 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.47 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.48 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.65 
 
 
467 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.55 
 
 
467 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.1 
 
 
490 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  39.23 
 
 
486 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  35.48 
 
 
493 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  36.42 
 
 
496 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  38.81 
 
 
486 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.12 
 
 
490 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  36.81 
 
 
493 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  32.06 
 
 
843 aa  190  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  54.37 
 
 
104 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.07 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.15 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.15 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.01 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.15 
 
 
500 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.8 
 
 
505 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.38 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.88 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.46 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.2 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.5 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.45 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.24 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.5 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.41 
 
 
512 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.65 
 
 
482 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.5 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.67 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.29 
 
 
473 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.08 
 
 
473 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.46 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.36 
 
 
479 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.3 
 
 
454 aa  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.22 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.93 
 
 
475 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.17 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.05 
 
 
481 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.64 
 
 
477 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1989  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.86 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382914  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.59 
 
 
480 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.17 
 
 
487 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.54 
 
 
454 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.33 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.94 
 
 
487 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.68 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  38.27 
 
 
114 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.43 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.8 
 
 
475 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  25.49 
 
 
469 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.55 
 
 
463 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.07 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.05 
 
 
486 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0753  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.46 
 
 
550 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0765877  normal  0.622658 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.99 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.43 
 
 
541 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.76 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.86 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.01 
 
 
471 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.94 
 
 
497 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.93 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.81 
 
 
470 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.11 
 
 
434 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.39 
 
 
482 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.39 
 
 
434 aa  57  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.89 
 
 
484 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.23 
 
 
486 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.7 
 
 
479 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>