36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1696 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  769    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  55.69 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  51.72 
 
 		 193 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.45 
 
 		 631 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.37 
 
 		 581 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25 
 
 		 1679 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  28.81 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  22.5 
 
 		 816 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1389 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.75 
 
 		 788 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  33.75 
 
 		 788 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.75 
 
 		 788 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  24.76 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  27.76 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  29.36 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  24.85 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  32.72 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  26.75 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.18 
 
 		 763 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  24.74 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.2 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  17.68 
 
 		 2096 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  28.9 
 
 		 603 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  26.86 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  22.3 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  24.15 
 
 		 1266 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  24.87 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  27.32 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  28.24 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  28 
 
 		 583 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  30.67 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3638  chromosome segregation ATPase-like protein  19.35 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1789 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  25.24 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  28.44 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  32.11 
 
 		 547 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>