134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0386 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 350 aa  721    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  52.06 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  54.01 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  47.99 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  48.22 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  39.87 
 
 		 329 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  36.23 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  24.62 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  24.31 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  20.71 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  20.75 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  21.41 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.26 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.3 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  22.39 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  21.1 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.26 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  24.26 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.33 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.38 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  28.43 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.82 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  19.63 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.73 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  21.74 
 
 		 458 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  21.3 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  28.43 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  28.43 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.73 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.81 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  22.17 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2231  glycosyl transferase family protein  21.87 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  18.89 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  28.43 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  28.43 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.73 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.85 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2351  glycosyl transferase family protein  21.99 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.33 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.33 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.19 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.6 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  21.07 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  20.24 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.18 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  22.06 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.88 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  20.9 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  21.75 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  21.45 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2335  glycosyl transferase family protein  21.81 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  21.92 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  19.71 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  20.62 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  21.6 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  21.25 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  21.15 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  21.1 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.77 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  21.23 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.77 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  23.32 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  19.93 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.65 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  23.32 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  23.32 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  20.39 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  20.27 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  21.96 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.4 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1700  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>