More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1474 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  77.3 
 
 
163 aa  263  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  59.46 
 
 
167 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.21 
 
 
166 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
169 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  51.95 
 
 
170 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.06 
 
 
176 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.78 
 
 
169 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.48 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  48.48 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.48 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  48.48 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.29 
 
 
169 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.38 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.75 
 
 
169 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  46.78 
 
 
170 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.2 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  49.67 
 
 
169 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  48.73 
 
 
172 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.39 
 
 
163 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.91 
 
 
163 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  43.09 
 
 
188 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  44.91 
 
 
163 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  44.91 
 
 
163 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.29 
 
 
167 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.43 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.73 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.58 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.8 
 
 
173 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  50.79 
 
 
175 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  44.07 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.21 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  48.41 
 
 
163 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  40.78 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.78 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  46.81 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.32 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.46 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  48.41 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  41.38 
 
 
177 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  38.17 
 
 
182 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  47.01 
 
 
179 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  52.78 
 
 
180 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.12 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.57 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.01 
 
 
168 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.57 
 
 
168 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.57 
 
 
168 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  43.8 
 
 
215 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  38.86 
 
 
175 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  36.36 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  48.57 
 
 
165 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  44.74 
 
 
177 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.8 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  36.84 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  39.66 
 
 
173 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  43.54 
 
 
135 aa  111  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 
178 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 
184 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 
127 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  40.77 
 
 
187 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.57 
 
 
196 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 
178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 
178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
169 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
169 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  48.54 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.09 
 
 
178 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.16 
 
 
172 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  34.09 
 
 
178 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  34.46 
 
 
179 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
173 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.26 
 
 
173 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 
189 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 
174 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.17 
 
 
182 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
174 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  33.71 
 
 
180 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>