60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4666 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
350 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  56.86 
 
 
346 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  55.37 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  55.37 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  55.37 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  39.04 
 
 
352 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  39.55 
 
 
343 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  39.38 
 
 
212 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  39.9 
 
 
212 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  41.05 
 
 
212 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  38.86 
 
 
212 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  38.86 
 
 
212 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  38.86 
 
 
212 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  36.81 
 
 
219 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  38.2 
 
 
212 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  36.41 
 
 
212 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  35.32 
 
 
211 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  36.08 
 
 
213 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  35.16 
 
 
212 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 
233 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  34.62 
 
 
222 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  32.49 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  30.3 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  26.6 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 
1204 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  27.22 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  25.76 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.39 
 
 
219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  27.39 
 
 
219 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  27.98 
 
 
268 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  27.39 
 
 
219 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.39 
 
 
219 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  27.39 
 
 
219 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 
244 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.75 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  33.56 
 
 
202 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  26.75 
 
 
219 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  32.03 
 
 
248 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  27.75 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  22.56 
 
 
224 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  24.4 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  29.45 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  22.44 
 
 
238 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
224 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 
425 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
423 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
418 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>