36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1287 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1287  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  850    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0477  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2425  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1943  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08846  tpr/glycosyl transferase domain protein  25.25 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0567  glycosyltransferase-like protein  27.18 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  20.87 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1576  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.84 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0359655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1698  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  26.84 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2930  TPR/glycosyl transferase domain-containing protein  23.53 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000283955  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0623  hypothetical protein  23.59 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0305747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  19.28 
 
 
405 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4436  glycosyltransferase-like protein  21.22 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  20.34 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0572  glycosyl transferase group 1  20.73 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1981  hypothetical protein  25.23 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0684  hypothetical protein  20.19 
 
 
437 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  20.24 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  21.37 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3262  hypothetical protein  21.78 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3880  hypothetical protein  22.67 
 
 
441 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  19.09 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0836  hypothetical protein  25.59 
 
 
423 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060649  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0635  hypothetical protein  24.1 
 
 
463 aa  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
398 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  27.01 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1310  hypothetical protein  25.42 
 
 
463 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5011  hypothetical protein  22.77 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1838  hypothetical protein  25.85 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000272519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4432  hypothetical protein  27.2 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.361028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3878  Glycosyltransferase-like protein  21.95 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3326  hypothetical protein  26.17 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2124  hypothetical protein  25.42 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0143699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0636  hypothetical protein  20.87 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0247  hypothetical protein  23.03 
 
 
443 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>