More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4493 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1793  hypothetical protein  39.6 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_39  putative lipoprotein  35.69 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0742904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  31.85 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04718  lipoprotein, putative  32.19 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0504656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05513  Sulfatase modifying factor 1 precursor-like protein (C-alpha-formyglycine-generating enzyme 1)  31.62 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04702  lipoprotein, putative  31.51 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  29.77 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.93 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.5 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.22 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.73 
 
 		 826 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  26.92 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.46 
 
 		 586 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 		 517 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  30.17 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.7 
 
 		 952 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  39.23 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.13 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.84 
 
 		 751 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.66 
 
 		 517 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 		 829 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.35 
 
 		 614 aa  88.2  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.65 
 
 		 742 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  38.17 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.18 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  29.66 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  26.86 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  25.94 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.28 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  34.59 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.68 
 
 		 922 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  28.05 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.05 
 
 		 554 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  25.86 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32.86 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  35.81 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.63 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  33.53 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  29.51 
 
 		 668 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  30.33 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  27.76 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1196 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.45 
 
 		 862 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  35.03 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  28.36 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  31.02 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  34.46 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  29.09 
 
 		 892 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.22 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.11 
 
 		 616 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.65 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.22 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 1818 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.96 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  35.34 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  27.61 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  36.67 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  26.73 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  27.92 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  34.85 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.67 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  27.81 
 
 		 768 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  33.08 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  33.85 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  27.47 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1911 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  26.43 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.07 
 
 		 781 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  33.83 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  29.5 
 
 		 877 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.38 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.14 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1581 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>