More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0682 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  81.71 
 
 		 421 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  81.71 
 
 		 423 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  76.25 
 
 		 421 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  76.25 
 
 		 421 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  81.47 
 
 		 423 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  79.81 
 
 		 421 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  78.15 
 
 		 424 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  78.38 
 
 		 421 aa  676    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  100 
 
 		 421 aa  854    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  81.71 
 
 		 421 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  81.71 
 
 		 423 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  59.47 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  57.52 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  57.21 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  57.42 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  56.39 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  56.63 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  56.52 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  56.87 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  48.66 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  48.18 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  48.18 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  48.31 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  47.58 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  45.89 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  50 
 
 		 415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  46.63 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  46.12 
 
 		 577 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  46.63 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  46.63 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  46.63 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  46.63 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  46.63 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  46.38 
 
 		 415 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  45.65 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  45.68 
 
 		 420 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  44.79 
 
 		 416 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  44.55 
 
 		 416 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  44.55 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  44.31 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  44.26 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  43.65 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  45.04 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  45.04 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  45.85 
 
 		 416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  45.45 
 
 		 422 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  44.12 
 
 		 422 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  45.76 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  43.13 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  38.16 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  42.02 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  38.5 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.1 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  39.53 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  34.78 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  32.6 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  33.9 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  34.14 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  34.3 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  31.94 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  32.69 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  31.94 
 
 		 450 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  31.94 
 
 		 450 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  37.71 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  32.96 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  37.23 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  34.22 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  36.85 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  32.29 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  32.74 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  34.02 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  31.88 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.49 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.3 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  28.98 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.71 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  30.24 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  30.24 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.75 
 
 		 450 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  31 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  29.64 
 
 		 489 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.53 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  29.84 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  29.07 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.36 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  29.07 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  30.1 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  29.28 
 
 		 484 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  30.07 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  30.07 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  30.07 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  30.07 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  30.2 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  29.71 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  34.33 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  30.44 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  28.92 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  29.75 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  31.03 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  29.46 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>