More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0246 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  69.83 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  66.38 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  62.93 
 
 		 117 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  62.93 
 
 		 117 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  58.62 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  58.62 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  60 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  60 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  59.13 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  59.13 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 117 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  59.13 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  59.13 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  59.13 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  59.13 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  58.65 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  57.39 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  54.78 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  55.17 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  56.03 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  55.17 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  56.03 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  54.31 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  54.31 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  55.17 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  51.3 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  53.1 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  52.21 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  52.17 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  52.5 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  50.43 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  51.72 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 114 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  48.7 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  48.28 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  49.12 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  44.74 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  45.22 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  45.69 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>