More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1454 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 347 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  76.32 
 
 		 344 aa  537  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  78.1 
 
 		 347 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  74.64 
 
 		 347 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.51 
 
 		 345 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.43 
 
 		 347 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.64 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.8 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.67 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.06 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  53.27 
 
 		 335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.74 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.27 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.14 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.68 
 
 		 350 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 367 aa  348  6e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.65 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.56 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.56 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.61 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  50.44 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.61 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.61 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.61 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 340 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.32 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  51.51 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 336 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.29 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  49.85 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.06 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.61 
 
 		 330 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.52 
 
 		 338 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.9 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.18 
 
 		 334 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  322  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  322  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 336 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 341 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.26 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.68 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.26 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.21 
 
 		 335 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.27 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 349 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.21 
 
 		 354 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.92 
 
 		 334 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.38 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.09 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  47.93 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 		 336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.68 
 
 		 354 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  50 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.29 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.89 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>