89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1087 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  100 
 
 
311 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  47.9 
 
 
287 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  45.1 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  43.41 
 
 
312 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  46.49 
 
 
312 aa  278  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.97 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  42.43 
 
 
313 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  29.15 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  29.1 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.07 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.71 
 
 
285 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30.5 
 
 
272 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30 
 
 
284 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.59 
 
 
285 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.28 
 
 
300 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.76 
 
 
297 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.55 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  26.65 
 
 
414 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  27.65 
 
 
299 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  24.6 
 
 
287 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.16 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.16 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.21 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  26.22 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  25.32 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  25.95 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  25.32 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  25.91 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.71 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.3 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.81 
 
 
308 aa  79  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.65 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  27.35 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  28.02 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  28.87 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.17 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.17 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.17 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2352  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.17 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  26.51 
 
 
513 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.45 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.12 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 
491 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0992  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.6 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01974  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.21 
 
 
282 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
503 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01963  hypothetical protein  28.21 
 
 
282 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  26.17 
 
 
309 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  31.05 
 
 
486 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1573  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.21 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  normal  0.876119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1589  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.21 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2209  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.21 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.41 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  26.72 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3006  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.69 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24680  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  27.43 
 
 
536 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.88 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  25.51 
 
 
490 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  27.04 
 
 
517 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  27.04 
 
 
517 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2361  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.69 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  34.13 
 
 
217 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  30.61 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  28.28 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 
492 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  27.04 
 
 
496 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1164  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.18 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.33 
 
 
274 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  24.54 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  24.37 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3192  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 
497 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0100093  hitchhiker  0.000000000975834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2682  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.29 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  28.06 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  23.83 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  31.09 
 
 
210 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.81 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.5 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.06 
 
 
199 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  30.19 
 
 
210 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.78 
 
 
163 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.91 
 
 
287 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
292 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  28.33 
 
 
494 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  23.91 
 
 
287 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4163  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 
482 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.813535  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  23.91 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5315  transcriptional regulator Ada  24.88 
 
 
509 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  23.91 
 
 
213 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>