62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3506 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  100 
 
 		 434 aa  897    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  40.96 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  30.45 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  26.68 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  27.19 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  28.28 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  26.05 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 		 934 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25.45 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  25.47 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  25.14 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  19.37 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  22.14 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.38 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  22.13 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.31 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  20.28 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 963 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  27.01 
 
 		 1328 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  27.33 
 
 		 1300 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.68 
 
 		 1241 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.51 
 
 		 797 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2036 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.52 
 
 		 1969 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.22 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  21.82 
 
 		 1812 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.8 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.98 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  21.53 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  21.17 
 
 		 1311 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.06 
 
 		 774 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  22.59 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  21.72 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.41 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.41 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  26.42 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 643 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.28 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.41 
 
 		 626 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.9 
 
 		 2272 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  21.25 
 
 		 687 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.94 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.94 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.64 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.09 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  23.13 
 
 		 475 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1067 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>