31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1819 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  39.09 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  33.55 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  34 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  30.81 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  34.29 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  31.76 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  38.55 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  30.11 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  28.49 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  29.09 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  34.83 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  30.86 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  28.49 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  28.49 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  29.63 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.07 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  30.21 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  27.38 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  33.02 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  29.31 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.9 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  35.24 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.93 
 
 		 170 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  27.98 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  33.02 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  40.43 
 
 		 164 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>