49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3424 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  43.71 
 
 		 1042 aa  848    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  51.05 
 
 		 952 aa  915    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  100 
 
 		 956 aa  1961    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  52.48 
 
 		 948 aa  945    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  51.1 
 
 		 954 aa  906    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  63.04 
 
 		 983 aa  1186    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  63.75 
 
 		 913 aa  1181    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  50.88 
 
 		 954 aa  907    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  92.78 
 
 		 969 aa  1811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  63.41 
 
 		 913 aa  1178    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  81.55 
 
 		 962 aa  1523    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  81.22 
 
 		 962 aa  1520    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  93.61 
 
 		 955 aa  1857    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  93.15 
 
 		 963 aa  1820    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  79.87 
 
 		 962 aa  1533    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  79.53 
 
 		 978 aa  1503    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  64.12 
 
 		 917 aa  1193    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  67.5 
 
 		 889 aa  1210    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  83 
 
 		 949 aa  1643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  66.38 
 
 		 1002 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  51.71 
 
 		 941 aa  924    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  81.98 
 
 		 949 aa  1566    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  45.75 
 
 		 908 aa  823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  80.9 
 
 		 960 aa  1558    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  78.37 
 
 		 960 aa  1536    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  64.69 
 
 		 973 aa  1221    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  92.7 
 
 		 659 aa  1214    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  94.44 
 
 		 955 aa  1838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  93.04 
 
 		 963 aa  1816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  49.72 
 
 		 938 aa  909    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  62.82 
 
 		 980 aa  1178    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  37.84 
 
 		 964 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  29.41 
 
 		 924 aa  351  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.56 
 
 		 916 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.56 
 
 		 916 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  58.08 
 
 		 240 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.45 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.25 
 
 		 815 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.64 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22.8 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.44 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.89 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  24.2 
 
 		 841 aa  59.7  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.23 
 
 		 864 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.29 
 
 		 827 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.69 
 
 		 855 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.62 
 
 		 866 aa  48.5  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  22 
 
 		 855 aa  48.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  24.77 
 
 		 803 aa  47  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>