More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3263 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  100 
 
 		 400 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  52.89 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  48.63 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  50 
 
 		 390 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  51.44 
 
 		 391 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  51.99 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 391 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  47.91 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  47.68 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  47.35 
 
 		 392 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.35 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  47.35 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  51.72 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  51.04 
 
 		 389 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  50.65 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.73 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  45.72 
 
 		 383 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  49.6 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  46.6 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  52.27 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.2 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.66 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  50.27 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  49.32 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.21 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.45 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  49.04 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.81 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.6 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  40.31 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  34.73 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.25 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 533 aa  266  5.999999999999999e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  44.84 
 
 		 373 aa  263  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.99 
 
 		 392 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.74 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  43.71 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  43.71 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.27 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.19 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  48.22 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.57 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  38.99 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  48.39 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.05 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  42.86 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.86 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.09 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.37 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.09 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.17 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.73 
 
 		 1143 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  49.32 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.85 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 407 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  41.86 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  42.05 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.21 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 1139 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.42 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.16 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.41 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  40.11 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.54 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.22 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.66 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  37.84 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.94 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>