More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2748 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 185 aa  295  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 185 aa  295  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  76.5 
 
 		 185 aa  293  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  71.2 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  74.32 
 
 		 185 aa  286  9e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  71.58 
 
 		 185 aa  286  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  73.89 
 
 		 243 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  74.72 
 
 		 197 aa  279  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  74.32 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  68.85 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  67.21 
 
 		 185 aa  274  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  72.38 
 
 		 186 aa  274  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  68.31 
 
 		 185 aa  274  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  68.31 
 
 		 185 aa  273  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  73.77 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  68.13 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  73.22 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  69.35 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  69.06 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 193 aa  267  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  67.58 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  67.74 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  68.28 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 186 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  68.28 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  71.04 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  66.13 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  65.03 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 183 aa  251  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  63.74 
 
 		 186 aa  244  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 181 aa  244  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 193 aa  244  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  243  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  59.56 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  62.84 
 
 		 189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  240  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  62.79 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>