189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1406 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  66.24 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  63.4 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  64.96 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  63.29 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  63.97 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  64.44 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  62.45 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  62.18 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  64.44 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  63.27 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  58.68 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  61.14 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  59.23 
 
 		 254 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  57.2 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  64.25 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  57.94 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  60.49 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  59.92 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  61.25 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  57.81 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  64.26 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  62.11 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  58.8 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  57.68 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  58.37 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.4 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  59.74 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  55.84 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  54.77 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  52.26 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  52.61 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  52.61 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  51.95 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.38 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  52.05 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  51.45 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.52 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  51.52 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  51.98 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  48.33 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  51.1 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  50.66 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  50.66 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  50.66 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  50.65 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50.43 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  48.9 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  51.08 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  51.08 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  51.08 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  49.33 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  50.42 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  52.94 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50.21 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  48.93 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  48.5 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.31 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  51.97 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  51.97 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  46.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.83 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  50.41 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  50.85 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.34 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  49.34 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  47.62 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  48.56 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  47.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  49.12 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  50.22 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  55.27 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  48.36 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  45.78 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  45.85 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  48.1 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  49.56 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  50.62 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  47.81 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  47.81 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  47.81 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  49.16 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  46.26 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  50.43 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  47.39 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  47.39 
 
 		 249 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  46.78 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>