More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0591 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  100 
 
 		 318 aa  617  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  79.13 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  78.03 
 
 		 319 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  76.14 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  29.45 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 422 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1972  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  28.25 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  28.31 
 
 		 481 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  25.41 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  26.17 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 446 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  28 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.62 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.52 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  27.51 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.52 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  27.96 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.6 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  26.4 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  26.2 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  26.2 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  26.2 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.72 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  24.58 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  25.24 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  26.4 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3013  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.265613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1547  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  28 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>