66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1803 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  58.62 
 
 
242 aa  271  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  51.91 
 
 
240 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  53.3 
 
 
240 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  52.84 
 
 
240 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  42.04 
 
 
245 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  38.67 
 
 
244 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  38.84 
 
 
247 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  38.84 
 
 
247 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.68 
 
 
241 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  38.39 
 
 
247 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  37.78 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  40.18 
 
 
246 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  41.03 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  37.78 
 
 
247 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  38.84 
 
 
247 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  38.39 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.78 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  38.39 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  38.39 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  37.14 
 
 
244 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  40.18 
 
 
244 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  38.94 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
238 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.22 
 
 
251 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.6 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
241 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.68 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  34 
 
 
235 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  32.41 
 
 
241 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  29.24 
 
 
236 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  31.19 
 
 
268 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  30.38 
 
 
235 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  36.47 
 
 
239 aa  99  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 
240 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  29.39 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.62 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  33.75 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  27.56 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  27.11 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.75 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  27.23 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  27.23 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  26.48 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  27.19 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.54 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  26.75 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  26.75 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  26.75 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  24.56 
 
 
272 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 
248 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  27.15 
 
 
241 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  26.75 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  25.52 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  24.78 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  24.56 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  28.98 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>