65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0943 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 242 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  43.62 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  41.71 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  40.33 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  41.99 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  44.75 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.44 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  36.32 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.91 
 
 		 208 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  40.66 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  36.56 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  35.8 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  32.97 
 
 		 192 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  31.41 
 
 		 309 aa  91.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  30.3 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  29.92 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  28.91 
 
 		 347 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.95 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  28.78 
 
 		 338 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  30.93 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  29.09 
 
 		 458 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.06 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  32.43 
 
 		 465 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.91 
 
 		 444 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  29.66 
 
 		 317 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  27.07 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.41 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  32.26 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  26 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  32 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.05 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  35.11 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.1 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30.77 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  29.63 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  32.97 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  32.97 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.52 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.38 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.06 
 
 		 203 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  29.09 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  31 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  30.56 
 
 		 495 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  26.55 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  31.91 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  30.61 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  30.61 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.08 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  31.68 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.83 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  27.21 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  29.17 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  37.11 
 
 		 331 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  29.81 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.31 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  29.29 
 
 		 162 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>