More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0563 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  100 
 
 		 325 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  84.92 
 
 		 325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  83.08 
 
 		 325 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  82.15 
 
 		 342 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  83.55 
 
 		 310 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  61.11 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.26 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.03 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.23 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.74 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.95 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.72 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.25 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.16 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 		 326 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  46.39 
 
 		 327 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  45.06 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  44.24 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.42 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.12 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  40.13 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  38.63 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.94 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.99 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  35.44 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.71 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2185  ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.72 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  37.84 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.64 
 
 		 335 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.42 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.63 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.63 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  34.06 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.71 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  35.12 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  35.44 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.82 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  34.37 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  35.14 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  35.14 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  35.14 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  36.34 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.52 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>