More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4074 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
165 aa  332  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  70.06 
 
 
175 aa  236  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.33 
 
 
181 aa  229  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.64 
 
 
188 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.46 
 
 
197 aa  215  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.65 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.45 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  47.86 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.45 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.86 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.33 
 
 
180 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.53 
 
 
199 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
211 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.17 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.32 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.17 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.13 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.28 
 
 
135 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  43.88 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.94 
 
 
203 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 
217 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.54 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.96 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  45.45 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.03 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.45 
 
 
131 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  45.45 
 
 
175 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.06 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  42.25 
 
 
167 aa  111  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  42.65 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  44.29 
 
 
218 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.03 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  36.91 
 
 
163 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  36.91 
 
 
163 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.76 
 
 
222 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  39.86 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.48 
 
 
175 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 
163 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  40.26 
 
 
167 aa  105  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
182 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
163 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
188 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  39.44 
 
 
165 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  39.86 
 
 
182 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  39.57 
 
 
226 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 
169 aa  105  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.86 
 
 
254 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.52 
 
 
204 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.09 
 
 
238 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  39.72 
 
 
160 aa  104  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
162 aa  104  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  45.54 
 
 
163 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.73 
 
 
167 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 
176 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.23 
 
 
239 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 
176 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.23 
 
 
239 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  41.26 
 
 
162 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.23 
 
 
239 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
171 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
164 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  41.26 
 
 
161 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.3 
 
 
211 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
182 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.53 
 
 
165 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  38.41 
 
 
273 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  39.69 
 
 
179 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  39.44 
 
 
162 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  39.87 
 
 
196 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
182 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
182 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  39.16 
 
 
162 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
162 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  46.43 
 
 
178 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
182 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  43.86 
 
 
162 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 
161 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
187 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
187 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
167 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  39.16 
 
 
162 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>