More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3573 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 308 aa  633    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  29.73 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  28.83 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  28.83 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  30.36 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  30.36 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  30.36 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  30.36 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  30.36 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  29.25 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.97 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  33.33 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.1 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  27.24 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  34.98 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.41 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  25.52 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  29.74 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  27.95 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  30.65 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.67 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.7 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  25.27 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.45 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.56 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.69 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  27.21 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  27.21 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.92 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.69 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  27.21 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  27.11 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 326 aa  99  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  26.77 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  28.73 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  25.27 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  25.66 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>