More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1178 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.26 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.06 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.01 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.86 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  33.1 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  32.41 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  32.41 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  32.41 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 154 aa  97.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  97.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 154 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.05 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.82 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  34.19 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 		 155 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  34.25 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  35.86 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  33.11 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>