95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4425 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  100 
 
 
129 aa  270  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  70.54 
 
 
141 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  68.22 
 
 
131 aa  191  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 
137 aa  184  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  58.27 
 
 
144 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  55.12 
 
 
136 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  57.36 
 
 
139 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  56.82 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  56.25 
 
 
144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  57.36 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  57.36 
 
 
139 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  61.26 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 
134 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  56.06 
 
 
169 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  51.18 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  52.76 
 
 
166 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  57.03 
 
 
142 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  59.69 
 
 
141 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  60.47 
 
 
139 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  60.47 
 
 
139 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  58.91 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  58.14 
 
 
174 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  58.14 
 
 
155 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  57.36 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  57.36 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  57.36 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  57.36 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  57.36 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  36.28 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 
241 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 
223 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
253 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
227 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
226 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
227 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28.18 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.18 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
230 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  29.67 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
219 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  34.33 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  29.89 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
223 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  29.33 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  31.08 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 
247 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  29.87 
 
 
352 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
222 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  30.63 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  32.05 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.8 
 
 
393 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
421 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>