More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1611 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  100 
 
 		 460 aa  888    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  38.26 
 
 		 545 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  38.21 
 
 		 545 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  38.16 
 
 		 562 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  36.15 
 
 		 563 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  37.75 
 
 		 540 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  34.83 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 570 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  36.1 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2744  ABC transporter related  36.84 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 516 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  35.24 
 
 		 563 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  33.98 
 
 		 542 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  32.48 
 
 		 543 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  32.53 
 
 		 543 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  35.23 
 
 		 544 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  35.23 
 
 		 544 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  34.13 
 
 		 533 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  34.38 
 
 		 544 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  35.16 
 
 		 544 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  35.39 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  34.36 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 541 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  33.67 
 
 		 531 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 		 547 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.46 
 
 		 532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  33.53 
 
 		 553 aa  222  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  34.18 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  34.46 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  34.62 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  32.87 
 
 		 542 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  30.62 
 
 		 530 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.98 
 
 		 559 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.86 
 
 		 542 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  35.1 
 
 		 565 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 529 aa  219  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 572 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  34.01 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  30.85 
 
 		 555 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  33.46 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  34.39 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  34.43 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  34.64 
 
 		 529 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 551 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  34.06 
 
 		 563 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  34.64 
 
 		 529 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.98 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  33 
 
 		 545 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  30.4 
 
 		 530 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  33.19 
 
 		 535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 529 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  32.01 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 529 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  33.87 
 
 		 588 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  33.74 
 
 		 539 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  34.62 
 
 		 530 aa  216  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 536 aa  216  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  33.47 
 
 		 536 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  32.87 
 
 		 545 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  32.87 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.81 
 
 		 524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  34.69 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  35.29 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  33.98 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  34.43 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.86 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.6 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  34.26 
 
 		 525 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  34.36 
 
 		 537 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  34.41 
 
 		 551 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 		 572 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  34.44 
 
 		 532 aa  212  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  31.56 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.01 
 
 		 619 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  34.93 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  33.8 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  28.77 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  32.19 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  33.87 
 
 		 524 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  34.36 
 
 		 543 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  29.45 
 
 		 547 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  34.35 
 
 		 527 aa  210  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  34.22 
 
 		 540 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  34.09 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  32.53 
 
 		 551 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  30.84 
 
 		 548 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  30.4 
 
 		 545 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.67 
 
 		 547 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  32.68 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  34.06 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  31.24 
 
 		 549 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>