More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1079 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 575 aa  1102    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 		 560 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3200  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.78 
 
 		 574 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 589 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 		 557 aa  173  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  31.17 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  31.42 
 
 		 590 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 		 590 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 		 590 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  30.93 
 
 		 585 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.99 
 
 		 589 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 		 590 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  31.12 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.75 
 
 		 590 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  27.36 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 		 603 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  28.16 
 
 		 603 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.33 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 597 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 		 561 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 616 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.41 
 
 		 609 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.48 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 559 aa  126  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 		 611 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  25.92 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  27.8 
 
 		 556 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  27.57 
 
 		 575 aa  120  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 556 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 728 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 		 558 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 		 569 aa  115  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 		 576 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 		 551 aa  113  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  25.86 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 		 608 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.74 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 		 549 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  27.44 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.45 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  27.95 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  27.74 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  27.74 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 741 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.41 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 741 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 700 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 		 548 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.21 
 
 		 585 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.35 
 
 		 677 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  22 
 
 		 583 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  21.82 
 
 		 583 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.05 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  21.83 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.58 
 
 		 741 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  21.82 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 		 509 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  21.35 
 
 		 585 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 		 740 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  22.28 
 
 		 583 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.16 
 
 		 572 aa  97.8  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.42 
 
 		 545 aa  97.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.81 
 
 		 587 aa  97.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 		 692 aa  96.7  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 		 743 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 		 742 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.44 
 
 		 585 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>