68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1944 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  734    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  82.63 
 
 
353 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  30.35 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  29.13 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.3 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  26.5 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  27.07 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  25.99 
 
 
417 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  29.67 
 
 
318 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  27.87 
 
 
326 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  30.09 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.31 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.82 
 
 
329 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.43 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  26.19 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  30.34 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  25.53 
 
 
339 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  23.72 
 
 
323 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.78 
 
 
374 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  29.57 
 
 
346 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 
333 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.88 
 
 
330 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 
344 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  29.59 
 
 
361 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  29.32 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  29.32 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  25.08 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.59 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  29.59 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  27.05 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.51 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  29.32 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.4 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.4 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  27.06 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  25.45 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  26.21 
 
 
355 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  25.67 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  25.38 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.39 
 
 
344 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  27.14 
 
 
316 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  27.1 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  26.84 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  24.77 
 
 
319 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  24.77 
 
 
319 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  26.3 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.63 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  26.38 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  26.98 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  26.33 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  24.49 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  25.29 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  24.84 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  24.3 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  24.3 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.76 
 
 
943 aa  72.8  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.11 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.43 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  21.38 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  21.82 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  20.16 
 
 
552 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.32 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>