88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2407 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  34.03 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  30 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  31.45 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.56 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.8 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  26.43 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.62 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  30 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1166  regulatory protein RecX  25.9 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  48.15 
 
 		 253 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  37.93 
 
 		 198 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.93 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  31.11 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  40.58 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  26.09 
 
 		 129 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  26.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  39.68 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  39.68 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.53 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  46.94 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  42.37 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  26.53 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  28.85 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  29.94 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  30.92 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  31.47 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  31.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  29.71 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 293 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  25.9 
 
 		 220 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 285 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.48 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  21.38 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 293 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.3 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  27.41 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.77 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>