More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1027 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  84.3 
 
 		 243 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  80.91 
 
 		 249 aa  391  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2069  ABC transporter related  82.23 
 
 		 244 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.870513  normal  0.162781 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  57.08 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.08 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.36 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.7 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.61 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.24 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  53.11 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  52.1 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.42 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.1 
 
 		 246 aa  251  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.54 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 240 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  51.05 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  50.83 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.59 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  50.83 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  52.92 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.1 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.53 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.1 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.68 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.68 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.97 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  52.32 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.68 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  52.42 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  52.92 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  52.52 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.68 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  52.52 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  50.83 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  50.83 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  51.9 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50.62 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.14 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.03 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  51.65 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  53.33 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  49.16 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.56 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  51.25 
 
 		 246 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  51.87 
 
 		 245 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.09 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  50.43 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 257 aa  243  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.42 
 
 		 256 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  49.58 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.39 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  51.69 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  50.42 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51.71 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 240 aa  241  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 241 aa  241  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.39 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  53.65 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 242 aa  241  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  50.42 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  51.53 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  53.71 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.68 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  50.42 
 
 		 260 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>