More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0213 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  55.74 
 
 		 736 aa  889    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  44.79 
 
 		 731 aa  664    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.48 
 
 		 730 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  45.23 
 
 		 727 aa  655    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  655    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  44.17 
 
 		 730 aa  640    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  100 
 
 		 740 aa  1504    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  45.52 
 
 		 727 aa  662    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  44.73 
 
 		 731 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  95.14 
 
 		 740 aa  1455    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  94.86 
 
 		 740 aa  1432    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  44.52 
 
 		 730 aa  637    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  43.85 
 
 		 730 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  46.3 
 
 		 734 aa  679    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  54.1 
 
 		 736 aa  866    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  45.66 
 
 		 727 aa  667    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  46.36 
 
 		 730 aa  692    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  45.28 
 
 		 730 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  76.69 
 
 		 740 aa  1199    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  64.61 
 
 		 734 aa  1006    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  95.14 
 
 		 740 aa  1435    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  41.98 
 
 		 729 aa  597  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  43.13 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  40.74 
 
 		 729 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  41.14 
 
 		 728 aa  595  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  41.28 
 
 		 728 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  41.7 
 
 		 729 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.98 
 
 		 826 aa  420  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.43 
 
 		 828 aa  412  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.25 
 
 		 844 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  37.57 
 
 		 848 aa  330  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.43 
 
 		 842 aa  302  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  27.03 
 
 		 700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  27.07 
 
 		 700 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.32 
 
 		 715 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  28.12 
 
 		 692 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  27.42 
 
 		 697 aa  250  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  27.45 
 
 		 705 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.41 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  27.79 
 
 		 709 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  27.07 
 
 		 704 aa  247  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.26 
 
 		 706 aa  246  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  28.74 
 
 		 695 aa  246  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  28.17 
 
 		 698 aa  246  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  26.77 
 
 		 707 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  27.34 
 
 		 699 aa  244  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  26.78 
 
 		 704 aa  245  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  27.51 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  27.56 
 
 		 696 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  28.8 
 
 		 692 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  27.46 
 
 		 698 aa  243  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  27.73 
 
 		 694 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  26.23 
 
 		 704 aa  243  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  27.6 
 
 		 694 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  27.92 
 
 		 699 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.59 
 
 		 691 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  29.15 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.26 
 
 		 703 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  26.59 
 
 		 708 aa  242  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  28.95 
 
 		 699 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.14 
 
 		 695 aa  241  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  27.75 
 
 		 705 aa  241  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.9 
 
 		 689 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  28.19 
 
 		 695 aa  241  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.39 
 
 		 702 aa  240  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  27.84 
 
 		 696 aa  240  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.65 
 
 		 691 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.65 
 
 		 691 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.32 
 
 		 700 aa  239  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  27.07 
 
 		 703 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.38 
 
 		 697 aa  239  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.26 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  27.83 
 
 		 691 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  27.28 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.97 
 
 		 704 aa  238  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.11 
 
 		 692 aa  238  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  27.74 
 
 		 697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.99 
 
 		 691 aa  237  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  25.83 
 
 		 713 aa  237  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  27.28 
 
 		 700 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  26.38 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  28.42 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  27.19 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  27.32 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  27.19 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  27.19 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  30.13 
 
 		 985 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  27.49 
 
 		 690 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  26.85 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  26.94 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.2 
 
 		 689 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  26.93 
 
 		 693 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  25.81 
 
 		 691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  27.43 
 
 		 690 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  27.26 
 
 		 693 aa  234  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  27.69 
 
 		 689 aa  234  6e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  26.71 
 
 		 691 aa  234  6e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  27.48 
 
 		 691 aa  233  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  27.48 
 
 		 691 aa  233  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>