268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1376 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 443 aa  863    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  54.71 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  54.71 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  54.93 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  54.26 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  54.04 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  55.18 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  56.25 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  54.31 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  56.83 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  55.13 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  54.93 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  54.71 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  54.71 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  54.48 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  55.45 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  59.33 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  55.29 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  57.11 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  52.97 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  53.35 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  50.35 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.06 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  50.83 
 
 		 437 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  51.62 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  44.84 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  47.93 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  46.84 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  46.21 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  47.84 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  46.63 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  46.88 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  46.39 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  46.39 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  46.39 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  46.39 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  46.39 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  41.72 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  46.63 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  46.63 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  45.7 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  42.18 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  44.39 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  41.85 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.46 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  42.22 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  35.66 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  40.83 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  40.83 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  40.74 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  40.74 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  41.75 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  35.65 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  39.21 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  36.81 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  31.82 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.06 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  22.91 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  24.53 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  24.94 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  26.1 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  26.04 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  24.94 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  26.04 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  28.49 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  24.68 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  24.05 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  24.05 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  24.05 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  24.05 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  23.8 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  23.8 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  22.95 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  23.8 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  23.3 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.5 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  29.06 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  26.04 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  27.91 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  25.12 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  24.19 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  24.87 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  24.67 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  22.69 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  28.03 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  24.14 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  30.99 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  24.45 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.98 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  26.72 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  23.21 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  24.63 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  23.15 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  29.58 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  23.18 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  35.61 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>