38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1984 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  65.49 
 
 		 225 aa  310  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  66.37 
 
 		 224 aa  307  8e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  65 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  33.94 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  34.34 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  31.06 
 
 		 367 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  29.29 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.75 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  35.42 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  33.1 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  32.23 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.88 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  34.31 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  36.47 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.18 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.16 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  30.86 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  32.3 
 
 		 355 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  31 
 
 		 475 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  34.78 
 
 		 288 aa  52  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  36.47 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  34.07 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  38.2 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  28.83 
 
 		 499 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  37.65 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  27.54 
 
 		 336 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.79 
 
 		 389 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.62 
 
 		 365 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.23 
 
 		 317 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  27.23 
 
 		 591 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  32.11 
 
 		 380 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.86 
 
 		 1703 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  27.48 
 
 		 1414 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  32.11 
 
 		 380 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  36.78 
 
 		 1697 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  32.11 
 
 		 380 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>