227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0316 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  100 
 
 
359 aa  715    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  64.36 
 
 
355 aa  442  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  42.62 
 
 
361 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  44.62 
 
 
382 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  27.43 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  31.09 
 
 
359 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  30.81 
 
 
403 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  29.69 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  32.78 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.6 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  32.84 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  28.08 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  31.36 
 
 
369 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  28.57 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  31.94 
 
 
391 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  29.43 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  26.65 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  26.33 
 
 
395 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  31.63 
 
 
391 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  30.7 
 
 
392 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  26.22 
 
 
351 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  28.99 
 
 
350 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  28.99 
 
 
350 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  29.23 
 
 
362 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  28.36 
 
 
389 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  25.87 
 
 
387 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  28.88 
 
 
398 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  32.43 
 
 
348 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  27.08 
 
 
404 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  27.12 
 
 
351 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  30.9 
 
 
407 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  25.23 
 
 
386 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  28.2 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  25.4 
 
 
397 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  28.83 
 
 
372 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  27.58 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  27.22 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  26.6 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  24.62 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  27.81 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  27.58 
 
 
383 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  25.39 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  28.29 
 
 
393 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.59 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  28.97 
 
 
357 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  30.3 
 
 
384 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  30.52 
 
 
392 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  27.25 
 
 
386 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  25.91 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  25.9 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  24.64 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  29.89 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  25.63 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  27.99 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  33.73 
 
 
338 aa  90.1  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  25.07 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  27.25 
 
 
396 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  27.17 
 
 
389 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  27.81 
 
 
356 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  24.1 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.96 
 
 
383 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  26 
 
 
386 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  24.18 
 
 
382 aa  85.9  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  26.55 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  28.15 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  26.74 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  23.28 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  24.78 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  24.26 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  29.48 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  28.31 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  27.92 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  26.44 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  26.05 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.72 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  28.97 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  25.8 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  29.03 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  30.94 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  27.41 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  31.16 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  26.15 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  23.72 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  25.21 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  24.12 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  24.85 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  25.66 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.03 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  26.63 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.47 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>