More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2216 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
126 aa  256  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  71.07 
 
 
128 aa  185  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  68.8 
 
 
131 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  67.72 
 
 
127 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  69.42 
 
 
126 aa  176  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  65 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  65.49 
 
 
121 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 
115 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
114 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.55 
 
 
113 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  49.55 
 
 
113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.65 
 
 
115 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.55 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  47.86 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
114 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
112 aa  123  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
113 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
114 aa  120  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  49.55 
 
 
112 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  48.18 
 
 
114 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
114 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.67 
 
 
114 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
114 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  42.98 
 
 
123 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  47.75 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  50.45 
 
 
112 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
114 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
113 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
113 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  46.9 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  49.55 
 
 
112 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 
114 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
114 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
115 aa  116  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  50.45 
 
 
113 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 
114 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
114 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
116 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
114 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  41.59 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  53.61 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  47.22 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  48.65 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.21 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  47.22 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  43.24 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
112 aa  111  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>