More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03920 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  100 
 
 		 170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  99.33 
 
 		 257 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  98 
 
 		 228 aa  307  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  69.33 
 
 		 301 aa  220  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  69.33 
 
 		 301 aa  220  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 304 aa  217  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  65.33 
 
 		 301 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  67.33 
 
 		 301 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  67.33 
 
 		 299 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  67.33 
 
 		 299 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  66.67 
 
 		 301 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  66.67 
 
 		 301 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  64.67 
 
 		 303 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  63.33 
 
 		 301 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  63.33 
 
 		 301 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  66 
 
 		 183 aa  205  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  66 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  63.33 
 
 		 301 aa  205  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  63.33 
 
 		 304 aa  203  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  62.67 
 
 		 304 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  63.33 
 
 		 301 aa  201  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  63.33 
 
 		 301 aa  201  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  66.67 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  70.31 
 
 		 284 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  70.31 
 
 		 284 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  70.31 
 
 		 284 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  70.31 
 
 		 284 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 		 282 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 		 282 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  69.53 
 
 		 283 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  63.08 
 
 		 283 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  67.19 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  67.19 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  58.67 
 
 		 296 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  59.18 
 
 		 295 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  59.86 
 
 		 295 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  59.86 
 
 		 295 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  59.86 
 
 		 295 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  59.86 
 
 		 295 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  59.18 
 
 		 295 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  59.86 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  170  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  170  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  170  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  170  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  170  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  57.33 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  58 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  59.18 
 
 		 295 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  57.82 
 
 		 295 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  56.67 
 
 		 301 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  56.67 
 
 		 301 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  56.67 
 
 		 301 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  56.67 
 
 		 301 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3889  hypothetical protein  57.25 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  58.11 
 
 		 301 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  61.07 
 
 		 285 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  61.07 
 
 		 285 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  61.07 
 
 		 285 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  61.07 
 
 		 285 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  61.07 
 
 		 285 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 		 244 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  52.56 
 
 		 311 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  53.79 
 
 		 301 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  53.79 
 
 		 301 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  53.79 
 
 		 301 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  46.71 
 
 		 322 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  50.35 
 
 		 320 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1795  transposase  56.19 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>