More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02339 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  81.16 
 
 
223 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  66.43 
 
 
174 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  53.33 
 
 
199 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  41.84 
 
 
230 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  39.39 
 
 
172 aa  98.6  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  41.84 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  43.75 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  42.97 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  40.58 
 
 
194 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  38.73 
 
 
348 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.54 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  38.98 
 
 
446 aa  85.5  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  38.84 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  36.51 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  38.24 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  48.39 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  40.86 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  40.86 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.64 
 
 
490 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  37.12 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  37.23 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  45.36 
 
 
484 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  37.17 
 
 
392 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  36.23 
 
 
329 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  35.2 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  44.57 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  43.3 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  41.94 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  47.37 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  44.57 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40 
 
 
523 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.43 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.29 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.24 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.24 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  46.24 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  37.61 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  46.24 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.24 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  40.43 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.62 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  45.16 
 
 
646 aa  70.5  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.23 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40.43 
 
 
503 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.23 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.63 
 
 
741 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.23 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.23 
 
 
473 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.13 
 
 
438 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.94 
 
 
479 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  37.67 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  45.65 
 
 
464 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  37.67 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  37.67 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  37.67 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40.86 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  47.78 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  41.23 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  43.3 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.94 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  34.35 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  39.36 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.36 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  33.97 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.23 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  35.71 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  38.02 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  38.4 
 
 
453 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  39.36 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  37.14 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  37.67 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  36.76 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  38.36 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.76 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  41.59 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.31 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  29.74 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.23 
 
 
480 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  38.69 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  39.58 
 
 
465 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  37.96 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  33 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  37.96 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.71 
 
 
324 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  40 
 
 
195 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  41 
 
 
441 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  36.03 
 
 
386 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.46 
 
 
547 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  41.96 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  39 
 
 
448 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.78 
 
 
513 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.13 
 
 
417 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.71 
 
 
475 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  37.27 
 
 
464 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  38.04 
 
 
676 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  37.72 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  40.86 
 
 
457 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>