143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01421 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  52.21 
 
 		 217 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  52.17 
 
 		 219 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  52.17 
 
 		 219 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  52.17 
 
 		 219 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  52.17 
 
 		 219 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  52.17 
 
 		 219 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  47.06 
 
 		 221 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  45.38 
 
 		 230 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  49.57 
 
 		 240 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  45.22 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 200 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  45.83 
 
 		 220 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  47.06 
 
 		 237 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  39.81 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  38.66 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  39.81 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  31.03 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  34.26 
 
 		 232 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  32.17 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  36.19 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  38.53 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  38.68 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  34.23 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  35.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  33.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 		 234 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  30.28 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  32.11 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  30.36 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  37.63 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 235 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 237 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  37.76 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  33.94 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  31.53 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 232 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  33.94 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1942  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000627742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  35.87 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  31.82 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.46 
 
 		 253 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.07 
 
 		 215 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.61 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.65 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  36.27 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.96 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.91 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.15 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.67 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  27.45 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.97 
 
 		 312 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  27.93 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  32.71 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 232 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  26.55 
 
 		 214 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  29.36 
 
 		 566 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.61 
 
 		 414 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  36.49 
 
 		 317 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>