209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3531 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3531  lipoprotein PslD  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3303  polysaccharide export protein  95.75 
 
 		 259 aa  470  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0200741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  59.61 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3007  exopolysaccharide transporter  51.59 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 431 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  31.65 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 391 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  32.61 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.71 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  28.7 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.43 
 
 		 378 aa  62  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  32.85 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  32.85 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.85 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  32.85 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.85 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.85 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  32.85 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.85 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  24 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  34.51 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.29 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.29 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.29 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.33 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.06 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.61 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.61 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.61 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  29.07 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 992 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.78 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  27.67 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.14 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  29.02 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 426 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 495 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  27.4 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 384 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  32.77 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 426 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 364 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  29.09 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.88 
 
 		 392 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  26.13 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 347 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 428 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 386 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 375 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 193 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 377 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 495 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 495 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 379 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  31.51 
 
 		 700 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  26.18 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.68 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 919 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 992 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>