More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3183 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  78.42 
 
 		 278 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  69.63 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  50.56 
 
 		 283 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  50.19 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  50.19 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  49.81 
 
 		 290 aa  261  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  49.27 
 
 		 281 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  50.35 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  48.72 
 
 		 130 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  32.48 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  36.13 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  39.61 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  34.48 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  34.48 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  32.51 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  35.23 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  28.52 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.91 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  29.92 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  30.47 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  28.15 
 
 		 286 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  28.79 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  35.55 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  38.92 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  41.1 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  34.9 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  38.32 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  33.91 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  33.04 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  31.36 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  38.32 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  34.29 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  46.94 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  30.28 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  30.25 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  30.73 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  35 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  28.38 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.33 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  31.28 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  29.91 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  30.26 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  31.6 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  26.02 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  29.82 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  42.73 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  30.17 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  41.28 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  35.26 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  28.06 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  29.26 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  31.45 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  32.24 
 
 		 303 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  31.45 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  31.96 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  32.73 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  40 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  31.82 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  34.43 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  43.7 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  38.58 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  27.53 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  30.94 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  32.31 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  28.81 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  30.21 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  48.42 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  27.2 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  28.81 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  28.46 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  40.62 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  31.45 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  27.67 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  28.81 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  27.67 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  44.79 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  34.36 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  37.69 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  41.67 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  32.27 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  42.86 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  31.05 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  33.92 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  31.05 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  27.27 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  46.24 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.13 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  39.66 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  31.79 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  36.05 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.12 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  29.24 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  30.97 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  38.71 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  45.83 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.77 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  33.54 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  35.59 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>