More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2719 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  94.44 
 
 
270 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  75.37 
 
 
270 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  76.12 
 
 
270 aa  427  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  72.01 
 
 
280 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  72.01 
 
 
270 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  75 
 
 
270 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  71.27 
 
 
280 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  74.63 
 
 
270 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  73.51 
 
 
270 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  54.89 
 
 
273 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  52.99 
 
 
270 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 
284 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.74 
 
 
967 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 
291 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.79 
 
 
279 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.65 
 
 
286 aa  254  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.62 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 
284 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  41.94 
 
 
280 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.98 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.12 
 
 
274 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.78 
 
 
275 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
271 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
271 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
271 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
274 aa  218  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
287 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 
281 aa  208  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 
274 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 
273 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  41.25 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  40.3 
 
 
278 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
255 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
258 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
259 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  149  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.36 
 
 
260 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.53 
 
 
260 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.29 
 
 
662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.84 
 
 
659 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
260 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
259 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
257 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
277 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.18 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 
260 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
263 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
260 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
259 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
269 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.56 
 
 
661 aa  135  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
263 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.6 
 
 
662 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.5 
 
 
663 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.84 
 
 
662 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.37 
 
 
657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.96 
 
 
256 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 
257 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
258 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
267 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
259 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
261 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
264 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.34 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
257 aa  131  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
258 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
258 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 
280 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>