More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6306 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  96.92 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  86.97 
 
 		 256 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  86.13 
 
 		 256 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  86.55 
 
 		 256 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  86.02 
 
 		 256 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  82.35 
 
 		 256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  83.61 
 
 		 257 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  73.08 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  75.38 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  74.23 
 
 		 257 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  67.56 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  66.54 
 
 		 260 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  71.31 
 
 		 311 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  71.72 
 
 		 261 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  71.31 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  70.49 
 
 		 261 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  67.55 
 
 		 265 aa  337  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  71.6 
 
 		 259 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  71.19 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  63.64 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  67.23 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  65.43 
 
 		 264 aa  321  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  66.67 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  64.71 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  58.24 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  58.24 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  64.17 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  64.17 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  59.77 
 
 		 265 aa  305  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  62.92 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  62.08 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  56.59 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  58.51 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  55.56 
 
 		 263 aa  281  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.51 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  59.34 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  55.16 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  57.02 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  55.16 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  55.16 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  56.1 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  51.65 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  52.21 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  54.58 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  50.72 
 
 		 277 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  49.44 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  53.53 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.6 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  54.23 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.69 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.94 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  48.46 
 
 		 259 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.43 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  48.08 
 
 		 259 aa  244  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  49.03 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  48.85 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  49.25 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  49.41 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  49.81 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.17 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  50.39 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  47.92 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  48.1 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  46.79 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.79 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  47.19 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.79 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  49.58 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.69 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.69 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  46.42 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  46.42 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.42 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  48.84 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  50.62 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.82 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  51.68 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  47.69 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.08 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  48.61 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  49.79 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  48.61 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  47.19 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  48.61 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  48.11 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  49.6 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  47.76 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  51.46 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  47.76 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>