68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4950 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  96.92 
 
 
227 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  73.42 
 
 
226 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  72.97 
 
 
226 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  72.97 
 
 
226 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  73.42 
 
 
226 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  71.49 
 
 
226 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  71.95 
 
 
226 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  72.52 
 
 
222 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  68.47 
 
 
226 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  68.92 
 
 
229 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  52.51 
 
 
231 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
305 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.48 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.92 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
291 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
277 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
634 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.41 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.41 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  26.35 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  30.69 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  28.39 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  30.1 
 
 
629 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.58 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  30.19 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  27.53 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.87 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  27.53 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.54 
 
 
224 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  38.04 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  35.56 
 
 
245 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
307 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  28.77 
 
 
261 aa  41.6  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
178 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
457 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
265 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
278 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>