More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2850 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  100 
 
 		 301 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  99.67 
 
 		 301 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  87.92 
 
 		 299 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  86.53 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  86.53 
 
 		 299 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  86.53 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  86.2 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  87.21 
 
 		 299 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  85.52 
 
 		 299 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  69.49 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  72.47 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  48.97 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  51.58 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  52.28 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  52.63 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  35.52 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  34.03 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  37.9 
 
 		 289 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  30.85 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  37.05 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  36.7 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  37.55 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 		 275 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.61 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.15 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.27 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  38.35 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.56 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.21 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  37.02 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 280 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  36.69 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.21 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  35 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.18 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.18 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.39 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  31.52 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  31.52 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  31.52 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  31.52 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  31.52 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.42 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.03 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  33.1 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  34.3 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  27.55 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  31.13 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.37 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  35.59 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  33.73 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.17 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  29.55 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.48 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  31.2 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.08 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  28.06 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  37.83 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  31.66 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.09 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.55 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  32.28 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.88 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  30.35 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 371 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>