More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5186 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  96.58 
 
 		 380 aa  755    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 380 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  81.53 
 
 		 382 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  81.53 
 
 		 395 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  82.06 
 
 		 382 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  98.16 
 
 		 380 aa  764    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  94.74 
 
 		 380 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  78.36 
 
 		 388 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  76.25 
 
 		 384 aa  617  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  75.2 
 
 		 383 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  76.25 
 
 		 385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  58.58 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  53.14 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  55.67 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  52.52 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  53.97 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  52.37 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  51.72 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  50.66 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  48.81 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  50.53 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  50.4 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  49.6 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 		 382 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  50.92 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  49.09 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  48.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  49.21 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  49.35 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  49.21 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  49.21 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  45.93 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  50.65 
 
 		 383 aa  362  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  48.32 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  47.09 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  46.83 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  46.17 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  46.97 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  48.19 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  35.03 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  34.15 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  33.51 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 		 397 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  34.04 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  33.51 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  35.22 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.99 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  31.49 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  33.07 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.07 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.51 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  32.14 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  32.87 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  34.9 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.6 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.55 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  33.69 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  33.33 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  32.8 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  33.77 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  33.16 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  34.02 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  32.41 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  32.41 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.15 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  32.43 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.61 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  32.05 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  34.06 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  33.8 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  32.54 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  32.34 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.85 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  32 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.75 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  32.84 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.79 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>