260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1607 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1607  site-specific recombinase  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138506  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17191  site-specific recombinase  87.89 
 
 		 224 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17071  site-specific recombinase  86.83 
 
 		 207 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16951  site-specific recombinase  70.97 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.378024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  44.39 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  43.41 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.44 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  30.17 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  30.6 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  28.57 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  31.15 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  26.37 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  27.53 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  27.53 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22571  hypothetical protein  40.71 
 
 		 117 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  27.47 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  28.8 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  28.96 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  28.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  27.87 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  31.54 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  28.02 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  31.15 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  28.73 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  28.65 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  26.63 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  26.63 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.17 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  27.22 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  26.23 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  29.19 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  29.83 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  26.7 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  28.41 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.99 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.93 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  28.33 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  25.97 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.88 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  29.17 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  28.34 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  31.29 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.57 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  26.92 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  26.92 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  26.34 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  24.73 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  27.62 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  26.34 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  26.34 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.52 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  28.86 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  31.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  24.86 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  26.52 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  29.06 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  25.54 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  25.91 
 
 		 313 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  28.26 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  28.08 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>