More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1103 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  88.39 
 
 
267 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  93.96 
 
 
267 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.56 
 
 
267 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.87 
 
 
256 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.69 
 
 
256 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.7 
 
 
249 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.78 
 
 
265 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.3 
 
 
260 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.36 
 
 
266 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.28 
 
 
249 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.28 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.24 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.63 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.87 
 
 
248 aa  281  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.97 
 
 
251 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
249 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.32 
 
 
246 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
249 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.08 
 
 
259 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.56 
 
 
257 aa  265  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  45.78 
 
 
264 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
256 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.28 
 
 
253 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.28 
 
 
253 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.55 
 
 
263 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.06 
 
 
252 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  51.68 
 
 
248 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  42.23 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.9 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
238 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
252 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
238 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
251 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 
258 aa  248  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.53 
 
 
258 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.53 
 
 
257 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
261 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.71 
 
 
258 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.69 
 
 
266 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
258 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
256 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.48 
 
 
257 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.25 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.05 
 
 
241 aa  245  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.98 
 
 
252 aa  244  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.37 
 
 
244 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  45.89 
 
 
264 aa  241  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
262 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.93 
 
 
240 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  43.65 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
253 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
253 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  45.57 
 
 
253 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
253 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
253 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 
271 aa  238  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
246 aa  238  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  44.03 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.26 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 
255 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
254 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
275 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
251 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  45.83 
 
 
264 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.46 
 
 
222 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.75 
 
 
275 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
252 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
252 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
252 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
252 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
254 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
245 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 
257 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 
259 aa  234  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
263 aa  234  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.08 
 
 
266 aa  234  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.98 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>