More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60418 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60418  ATP-dependent RNA helicase DBP7 (DEAD-box protein 7)  100 
 
 
733 aa  1506    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.174628 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00204  ATP-dependent RNA helicase dbp7 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGX6]  42.07 
 
 
778 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01590  hypothetical protein  34.82 
 
 
948 aa  355  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  33.66 
 
 
560 aa  296  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14161  helicase_3  33.22 
 
 
540 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  31.52 
 
 
485 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  29.37 
 
 
609 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 
607 aa  224  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  31.63 
 
 
589 aa  218  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  29.72 
 
 
812 aa  217  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  30.88 
 
 
567 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  33.55 
 
 
859 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  29.24 
 
 
765 aa  213  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  29.27 
 
 
627 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  33.25 
 
 
481 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 
493 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  32.62 
 
 
710 aa  194  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  32.62 
 
 
755 aa  194  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 
493 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  31.38 
 
 
466 aa  190  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  30.45 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.32 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1807  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  29.88 
 
 
433 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.527975  normal  0.043326 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  31.37 
 
 
433 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  29.52 
 
 
583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  30.11 
 
 
672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.77 
 
 
420 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.72 
 
 
482 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  30.72 
 
 
482 aa  180  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.72 
 
 
482 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  30.72 
 
 
482 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  30.72 
 
 
559 aa  180  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  30.72 
 
 
482 aa  180  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.48 
 
 
571 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  30.72 
 
 
481 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.85 
 
 
466 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  31.91 
 
 
465 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.55 
 
 
455 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
482 aa  178  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 
479 aa  177  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.55 
 
 
567 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
514 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  31.25 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.34 
 
 
456 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  31.01 
 
 
495 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0465  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
407 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  29.67 
 
 
629 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.67 
 
 
629 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.09 
 
 
628 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  29.83 
 
 
394 aa  174  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 
560 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
509 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  29.56 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  29.36 
 
 
540 aa  173  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
498 aa  173  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.23 
 
 
598 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.73 
 
 
537 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  31.48 
 
 
443 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
584 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.7 
 
 
535 aa  173  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 
565 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  32.08 
 
 
516 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  30.9 
 
 
450 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.83 
 
 
454 aa  173  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.36 
 
 
453 aa  173  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.83 
 
 
454 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  27.49 
 
 
617 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
479 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  29.12 
 
 
527 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  30.58 
 
 
454 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.58 
 
 
454 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.7 
 
 
535 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.58 
 
 
454 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.58 
 
 
455 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.19 
 
 
418 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.58 
 
 
454 aa  172  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  30.58 
 
 
454 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  31.68 
 
 
436 aa  172  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  31.53 
 
 
429 aa  172  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.19 
 
 
418 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.1 
 
 
453 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.1 
 
 
453 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  29.75 
 
 
607 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.1 
 
 
453 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.58 
 
 
454 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.1 
 
 
453 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.1 
 
 
453 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.55 
 
 
580 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  29.36 
 
 
624 aa  171  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.95 
 
 
471 aa  171  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  27.82 
 
 
575 aa  171  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.95 
 
 
504 aa  171  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  29.84 
 
 
814 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.99 
 
 
443 aa  171  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  32.05 
 
 
446 aa  171  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1337  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
472 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  29.81 
 
 
495 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>