216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47526 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  100 
 
 		 444 aa  910    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  33.47 
 
 		 310 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  30.12 
 
 		 261 aa  123  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  31 
 
 		 269 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  29.51 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  29.61 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.67 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  29.84 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.37 
 
 		 289 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  26.39 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.39 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.39 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  28.52 
 
 		 273 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  28.52 
 
 		 273 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.39 
 
 		 259 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  30.36 
 
 		 274 aa  99.8  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.39 
 
 		 273 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.39 
 
 		 273 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 		 259 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  29.81 
 
 		 263 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  30.62 
 
 		 278 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  26.21 
 
 		 283 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  28.68 
 
 		 285 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  27.78 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.94 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  27.83 
 
 		 276 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  26.53 
 
 		 293 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  27.35 
 
 		 271 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  27.35 
 
 		 271 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.35 
 
 		 271 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  27.35 
 
 		 271 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  26.92 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  26.42 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  26.92 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  26.5 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  26.92 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  29.17 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  27.19 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  30.91 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  27.94 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  30.56 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  26.55 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  29.58 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  28.08 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  26.91 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  30.56 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  27.14 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  27.03 
 
 		 303 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  29.3 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  28.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  28.51 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  28.92 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  27.02 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  28.24 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  28.24 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  26.14 
 
 		 254 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  28.24 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  28.24 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  27.64 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  24.43 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  28.17 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  28.24 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.6 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  25 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  29.09 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  25.68 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  25.68 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  25.68 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  24.76 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  28.77 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  26.73 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  25.1 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  27.23 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  27.9 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.29 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  27.4 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  27.4 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  25.1 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  27.4 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  27.4 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  28.03 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>